Kariyerine, 2003 yılında gerçekleşen Irak Savaşı nedeniyle NTV'de çeviri haberler yaparak başlayan Üner, 2006 yılında Star TV'ye muhabir olarak geçiş yaptı.
Ardından CNN Türk, Habertürk ve Show TV gibi birçok büyük kanalda görev alan Üner, 2013 yılında meslektaşı Deniz Bayramoğlu ile evlendi.
Çiftin, bu evlilikten 'Güneş' adını verdikleri bir kız çocukları dünyaya geldi.
Ece Üner, daha önce verdiği bir röportajda yaşamındaki en büyük eksikliğin annesi olduğunu belirtmişti.
